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色譜儀器在分析儀器中具有重要地位。由于色譜儀的色譜柱具有的分離能力，把物質按保留時間大小進行分離，然后通過與標樣保留時間進行對比的方法確定物質性質，因此對未知樣品很難定性分析。而質譜儀是直接測定物質的質量數與電荷的比值(m/z)在定性分析方面既準確又快速。把色譜與質譜聯合起來使用，氣相色譜質譜聯用儀型式試驗實際上是把質譜儀作為色譜儀的一個通用檢測器來使用。

　　

質譜儀作為質量檢測器可以取代色譜儀的多種檢測器，通用性強，使用極其方便。而色譜儀有很多檢測器，如TCD、FID、ECD、FPD、NPD等，每種檢測器只有一定限度的適用范圍，不能通用，造成使用不便。所以說氣相色譜質譜聯用儀把色譜的分離作用與質譜計對未知樣品的準確鑒別能力相結合，把分析儀器提高到一個新水平，凡是能使用色譜儀的地方，均可以使用氣相色譜質聯用儀器。